代谢物是供试物因生物降解或非生物降解产生的所有物质，包括二氧化碳、生物合成物和结合残留物质。在环境风险评估中又分主要代谢物和相关代谢物。

主要代谢物：是指在土壤、水和沉积物的降解试验中，在任何一次检测时间点中摩尔分数或者放射性强度比例大于10%的代谢物。

相关代谢物：可能会对人们健康造成影响的代谢物。

环境风险评估中有些项目需要对母体、主要代谢物和相关代谢物进行评估。

环境风险评估中农药对水生生态、土壤生物的风险评估中要进行母体及主要代谢物的风险评估，对地下水需要进行母体及相关代谢物的风险评估。

对于代谢物可以根据其转化率判断是否为主要代谢物而进行风险评估，而相关代谢物在形成过程中引起的毒性效应，这些代谢物需要考虑在风险评估中。

相关代谢物毒性需要可以从以下几方面考虑：（来源于农药科学与管理）

（1）看代谢物与母体化合物是否有相同毒性作用机理，其毒性水平与母体差异不确定时，默认处理方法就是代谢物与母体具有相同毒性，且毒性较强的母体化合物其相关代谢物在风险评估中都被考虑，相反如果母体化合物毒性很低，代谢物在风险评估中可以不被考虑。

（2）代谢物可能与母体表现出相似的效应，但在代谢物毒性剂量很低的情况下就会产生毒性，就意味着代谢物毒性更强。

（3）代谢物是否含有与已知某种有毒化合物相同基团，这样就有可能根据获得的相似化学物质的参考数据信息来确定代谢物的毒性机理。